长崎大学发布这样的宣言：以国立大学法人化转变为契机，力图教育与研究的高度化与个性化，协同亚洲各地区共同前进，继续成为世界不可缺少的「知识情报传输基地」。

  在我们的中期目标中倡导：

• 把教育和研究两方面争创世界一流作为目标，推进战略性教育研究计划，谋求教育与研究的进一步高度化与个性化。
• 在「学生顾客主义」的标语下，充实基础教育、学部专业教育、大学院教育以提供最高水平的教育,同时在入学选拔、课外活动、就职等涉及学生生活的各方面进一步强化支援体制。
• 进行知识产权的适当管理，通过灵活运作知识产权与人、物资源的地域联合、产学官联合、国际性联合，推进教育与研究成果回归社会。

并使上述理念具体化。

  为了达到这些目标，长崎大学开展了以下富有特色的计划。

+ 所有学部实施AO入学考试

+ 以学生为对象的大学活性化

（1）以全校学生为对象的学生生活调查

（2）梦想大奖

+ 特色教育

（1）以特色的一年级教育为核心的教育改善

（2）制造能力教育

（3）心理教育

+ 当地教育的充实

（1）与当地合作的实践型医学教育项目

（2）大学发起的“医院再生”的当地医疗人员的培养

（3）孤岛教育的革新

（4）高中和大学合作的充实

+ 国际性丰富的教育

（1）以挖掘日荷交流历史为主轴的国际合作教育项目

+ 富有魅力的大学院教育

（1）海洋环境与资源恢复的研究者的培养

   ―大学院环东中国海实践教育的跨学科及国际性的培养―

（2）国际性传染病研究者和专科医生的培养计划

+ 教员的教育活动评价

+ 面向世界的研究据点的研究

（1）热带病和新兴传染病的研究

   （21世纪COE项目：热带病和新兴传染病的全球控制战略据点）

（2）原子能放射线对人体的影响和放射线危害国际医疗的开展

   （21世纪COE项目：放射线医疗科学国际联盟）

（3）海洋环境保护和海洋生物资源开发的研究

+ 立足当地的特色研究

（1）对长崎地域、地理特征（孤岛、斜坡、过疏）的研究

（2）「新长崎学」的构筑和网络情报发送

（3）教育危机对策项目（心理教育综合支援中心）

+ 其他特色研究

（1）文理结合型的环境科学研究

（2）社会基础设施的维护管理的研究

（3）东南亚经济研究

+ 长崎大学所藏珍贵资料的电子情报化

（1）幕府晚期和明治时期日本旧照片藏品

（2）幕府晚期和明治时期日本旧照片超高精细图像数据库

（3）幕府晚期和明治时期的旧照片虚拟展示会

（4）Glover图谱

（5）近代医学史数字图书馆

（6）武藤文库

+ 国际医疗协作和国际合作研究

（1）国际合作研究战略总部（CICORN）

（2）切尔诺贝利核泄漏事故的医疗支援

（3）Sumatra岛海面地震和海啸后的传染病流行对策基础调查

（4）常驻型海外热带病和传染病研究据点

+ 偏僻地区医疗的措施

+ 知识产权总部和长崎TLO设置

+ 开放性实验室的充实